Système ecclésiastique, préconisé par Calvin, qui donne le gouvernement de l'Église non à des dignitaires, mais à un corps mixte formé de laïcs et de pasteurs, nommé presbyterium.

Le système presbytérien a été adopté, avec des différences locales, par la plupart des Églises réformées : avec J. Knox (1560) en Écosse, où l'Église calviniste porte le nom de « presbytérienne » ; en France (1559) ; aux Pays-Bas (1571, 1618-1619) ; en Amérique du Nord (XVIII^e s.). L'Église presbytérienne anglaise n'obtint droit de cité qu'avec Cromwell (1643).

En 1877 s'est constituée une alliance des Églises presbytériennes qui est devenue, en 1921, l'Alliance réformée mondiale, groupant plus de 40 millions d'adhérents.