Sa thérapeutique a pour fondement une correspondance entre le monde extérieur (macrocosme) et les différentes parties de l'organisme humain (microcosme). Paracelse a ouvert la voie à la doctrine des spécifiques et à la thérapeutique chimique. Comme chirurgien, il est célèbre par sa théorie de la « mumie », le baume naturel, lymphe organisable, qui devait réparer d'elle-même le tissu.